いろいろな組織において、共に発現している遺伝子を調べたデータベースがあります。それが COXPRESdb です。
遺伝子名で検索することで、その遺伝子と共に発現していることが多い遺伝子の一覧が取得できます。また、それらの関係をネットワーク図として見ることもできます。
もとになる情報は、GEOに公開されたマイクロアレイデータが中心となっています。また、共に発現している遺伝子の情報に加え、タンパク間相互作用 ( Protein-Protein Interaction) の情報も付加され、確認できるようになっています。
> Obayashi T, Hayashi S, Shibaoka M, Saeki M, Ohta H, Kinoshita K. (2008) COXPRESdb: a database of coexpressed gene networks in mammals. Nucleic Acids Res. 36, D77-D82.
