Mouse Genome Informatics (MGI)

マウスの遺伝子情報のデータベースといえば、 “MGI” です。マウスの株や、ノックアウトの種類、遺伝子のアノテーション (GO) など、 マウスに関する様々な情報が登録されています。

この MGI を使って、特定の組織で発現していることが確認されたマウスの遺伝子を検索できます。

(1) まず、トップページから、 Expression を選択します。

MGI top
MGIのトップページ。Expression を選択

(2) Gene Expression Database (GXD) が表示されます。”Gene Expression Data Query” を選択します。

GXD の画面。Gene Expression Data Query を選択。
GXD の画面。Gene Expression Data Query を選択。

(3) 検索画面が表示されるので、組織の名称を入力します。さらにステージで絞り込むこともできます。

検索画面。組織の名称を入力。
検索画面。組織の名称を入力。

(4) 検索結果が表示されます。GXD では、マイクロアレイに限らず、いろいろな実験で発現を用いて確認された遺伝子の情報があります。主に論文で示された情報が根拠となっています。

MGI Gene Expression Data Query result
検索結果。

 

 

 

投稿者:

Atsushi Doi

株式会社セルイノベーター 取締役、研究開発部部長。理学博士。山口大学大学院理工学研究科修了。東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センターの特任助手を経て、株式会社GNIに主任研究員として勤務。その後、株式会社セルイノベーターの立ち上げに参加し、現在に至る。専門は、バイオインフォマティクス、おもにシステムバイオロジー。

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