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遺伝子発現解析(マイクロアレイ解析, RNA-seq)

株式会社セルイノベーターによる遺伝子発現解析手法とツールの紹介

  • はじめに
    • マイクロアレイデータの見方
    • 解析のステップ
  • 基礎知識
    用語の解説、GO解析、パスウェイ解析、ヒートマップなど。
    • GO解析
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  • データ視覚化(グラフの作成)
  • エンリッチメント解析
    DAVID または GSEA を用いた解析
    • DAVIDの操作ガイド
    • GSEA の操作ガイド
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  • 解析例
    公開データを解析した例。変動遺伝子の機能を見る、クラスタリング、ヒートマップの作成例など。
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アーカイブ

解析例2

iPS細胞のデータ、機能ごとに遺伝子群を抽出しクラスタリング、結果をヒートマップとして表示。

  • 2.1 iPS細胞のデータ、正規化
  • 2.2 stem cell 関連遺伝子のヒートマップ
  • 2.3 代謝系の遺伝子をクラスタリング
  • 2.4 機能でクラスタリング、ヒートマップ
  • 2.5 CD抗原、転写因子でクラスタリング、ヒートマップ
  • 2.6 組織が異なる場合の散布図
 
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