ここは、株式会社セルイノベーターによる解析情報のサイトです。解析担当者が、解析の手法とツールを紹介いたします。はじめに読んでいただくとよいと思われる記事をリストアップしました。
- マイクロアレイのイメージの誤解： マイクロアレイについてどのようなイメージを持っていますか？
- マイクロアレイデータ解析の流れ：解析の全体の流れを示します。
- 発現変動遺伝子の定義：何をもって発現が変動したと判断するのでしょう？2倍上がった？半分に下がった？
基礎的なコンテンツ
また、遺伝子発現解析（マイクロアレイ、RNA-seq）を理解するための基礎的なコンテンツは下記のものがあります。
- マイクロアレイデータの見方（RNA-seqも考え方は同じです）
- 解析のステップ
- 基礎知識（GO解析、パスウェイ解析、用語の解説）
- エンリッチメント解析（DAVID, GSEA）
実践的な解説
RのスクリプトやUNIXのコマンドなど、より実践的な解説については、舟尾先生や、門田先生のサイトや、統合tvなどをご覧ください。
- R-tips: 統計処理ソフトウェア R の解説です。初歩的な部分から丁寧に書かれています。
- (Rで)マイクロアレイデータ解析: 基本的な処理から最新のアルゴリズムまで、非常に多くの情報を提供されています。
- 統合tv: バイオインフォマティクスのデータベースやツールの使い方を動画で解説されています。
