Rat Genome Database (RGD)

マウスのデータベースは、 MGI であるのに対して、ラットのデータベースとして、 Rat Genome Database (RGD) があります。

Rat Genome Database (RGD)
Rat Genome Database (RGD)

マウスに対して、ラットでは QTL のデータが充実しているようです。それに関連して、 Disease Ontology もよく整理されています。下図は、 Obesity に関連した遺伝子がまとめられたページです。マウスとヒトのホモログの情報もいっしょに表示されますので、ラット以外を研究している研究者にとっても便利です。

Obesity に関連した遺伝子の一覧。Human, Mouse のホモログの情報もある。
Obesity に関連した遺伝子の一覧。Human, Mouse のホモログの情報もある。

また、パスウェイの情報もよく整理されていますので、おすすめです。

 

投稿者:

Atsushi Doi

株式会社セルイノベーター、主任研究員。理学博士。山口大学大学院理工学研究科修了。東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センターの特任助手を経て、株式会社GNIに主任研究員として勤務。その後、株式会社セルイノベーターの立ち上げに参加し、現在に至る。専門は、バイオインフォマティクス、おもにシステムバイオロジー。

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