GEOに登録された代表的な Platform

FIND PLATFORM を検索した例として、GEOに登録された代表的な Platform を挙げます。(一例ですので、必ず GEO のサイトでご確認ください。)

Affymetrix (GeneChip)

  • Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array: GPL570
  • Affymetrix Human Gene 1.0 ST Array [transcript (gene) version]: GPL6244 (probe set version とは異なります。)
  • Affymetrix Mouse Genome 430 2.0 Array: GPL1261
  • Affymetrix Mouse Gene 1.0 ST Array [transcript (gene) version]: GPL6246 (probe set version とは異なります。)
  • Affymetrix Rat Genome 230 2.0 Array: GPL1355
  • Affymetrix Rat Gene 1.0 ST Array [transcript (gene) version]: GPL6247

Agilent

  •  Agilent-028004 SurePrint G3 Human GE 8x60K Microarray (Probe Name Version): GPL14550
  • Agilent-026652 Whole Human Genome Microarray 4x44K v2 (Probe Name version): GPL13497 (v1 とは異なります。)
  • Agilent-028005 SurePrint G3 Mouse GE 8x60K Microarray (Probe Name version): GPL10787?
  • Agilent-026655 Whole Mouse Genome Microarray 4x44K v2 (Probe Name version): GPL11202 (v1 とは異なります。)
  • Agilent-028279 SurePrint G3 Rat GE 8x60K Microarray (Probe Name version): GPL15084
  • Agilent-028282 Whole Rat Genome Microarray 4x44K v3 (Probe Name version): GPL14746

Illumina

  • Illumina HumanWG-6 v3.0 expression beadchip: GPL6884
  • Illumina MouseWG-6 v2.0 expression beadchip: GPL6887
  • Illumina ratRef-12 v1.0 expression beadchip: GPL6101
 

投稿者:

Atsushi Doi

株式会社セルイノベーター 取締役、研究開発部部長。理学博士。山口大学大学院理工学研究科修了。東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センターの特任助手を経て、株式会社GNIに主任研究員として勤務。その後、株式会社セルイノベーターの立ち上げに参加し、現在に至る。専門は、バイオインフォマティクス、おもにシステムバイオロジー。

コメントを残す