RNA-seq についてのサーベイ

ここ10年ほどで、NGSの手法が広く使われるようになってから、RNA-seq について、検出されたリードのマッピングや、カウントの方法について様々なアルゴリズムやソフトウェアが考案されてきました。

RNA-seq のデータ解析について、非常によくまとめられたサーベイが昨年(2016年)出ていますので、ぜひ、一読をお勧めします。

A survey of best practices for RNA-seq data analysis

 

投稿者:

Atsushi Doi

株式会社セルイノベーター 取締役、研究開発部部長。理学博士。山口大学大学院理工学研究科修了。東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センターの特任助手を経て、株式会社GNIに主任研究員として勤務。その後、株式会社セルイノベーターの立ち上げに参加し、現在に至る。専門は、バイオインフォマティクス、おもにシステムバイオロジー。