Broad-Novartis Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE)

CCLE プロジェクトという、がんのセルラインのデータを収集するプロジェクトがあります。 Broad Institute を中心に行われており、得られたデータが公開されています。 現在、CNV, SNP と mRNA のマイクロアレイデータが公開されています。mRNA のマイクロアレイデータとしては、1000サンプルに近いデータがあります。raw データで 4.7GB と巨大ですが、ダウンロードすれば独自に解析することも可能です。このデータは、 GEO にも

GPL15308 として登録されています。

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Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE).
 

投稿者:

Atsushi Doi

株式会社セルイノベーター 取締役、研究開発部部長。理学博士。山口大学大学院理工学研究科修了。東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センターの特任助手を経て、株式会社GNIに主任研究員として勤務。その後、株式会社セルイノベーターの立ち上げに参加し、現在に至る。専門は、バイオインフォマティクス、おもにシステムバイオロジー。

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