ratio (=fold-change) > “2” と増加を判定したときは、対応する減少の判定は ratio < “0.5” となるでしょう。では、 ratio > “1.5” と判定したときは、対応する減少の判定は、いくつになるでしょう?
値は 1.5/2 = 0.75 倍になっています。よって、0.5 x 0.75 = 0.375 ???
この話は、log2変換してから (logFC) のほうが分かりやすいかもしれません。「ratio > 2 または ratio < 0.5」 これを logFC にすると次のようになります。
「logFC > 1 または logFC < -1」(絶対値の記号"||"を使うと |logFC| > 1)
ここで “1” は log2(2) です。”-1″ は log2(0.5) ですが、マイナスlog2(2) とも書けます。つまり、log2(1.5) に対応するのは、マイナスlog2(1.5) ということです。
logFC の値を ratio に変換 (unlog2) するには、「2のlogFC乗」を計算します。
> 2^1 # 2の1乗は2です。
> 2^(-1) # 2の-1乗は0.5です。
したがって、ratio < ?? に対応する値は、2のマイナスlog2(1.5)乗を計算します。
> 2^(-log2(1.5)) # 0.6666667
答えは ratio < 0.66 です。