MeV の使い方 3. t-検定

Agilent のマイクロアレイデータを想定して、 MeV の操作方法を紹介します。

1. MeV の起動とファイルの読み込み
2. 階層的クラスタリング
3. t-検定

3. t-検定

t-検定により、WT vs KO で差のある遺伝子を求める。

(1) 検定方法の選択

• “Statistics” ボタンから “t Tests” を選択。

(2)  t-検定のパラメーター

検定を行った上で、有意な差を持つ遺伝子群のクラスタリング図を作成。

• 1) “Between subjects” タブを選択。
• 2) “Cluster Selection” タブを選択。
• 3) 2つのグループに割り当てる。
• 4) “Hierarchical Clustering” タブを選択。”Construct Hierarchical Trees for:” にチェックを入れる。

続きます。