NCBI のウェブサイトには、様々な情報が集積されています。遺伝子名などで検索をすると、非常に多くの情報が表示されます。しかしながら、場合によっては、一部の情報だけ取得できればいいこともあります。
塩基配列だけを取得するには？
例えば、ある遺伝子の塩基配列だけを閲覧したい場合です。特に、複数の遺伝子について、それぞれの配列を調べようと思うと、IDを何回も入力したり、何度もリンクをクリックしたり、という操作をしなくてはなりません。
このようなニーズに応えて、多くのウェブサイト（またはデータベース）には、データの取得専用の問い合わせ方法（APIなどと呼ばれます）が用意されていることがほとんどです。
特定の遺伝子の塩基配列だけを取得する
特定の遺伝子の塩基配列だけを取得するには、下記のアドレスに問い合わせます。
上記の例では、FASTA形式のファイルがダウンロードされます。
http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/efetch.fcgi?db=nuccore&id=NM_001154&rettype=fasta&retmode=text
id の部分を変更すれば、ほかの遺伝子にも対応できます。また、rettype, retmode の部分を変更すれば、結果のファイルの形式の変更も可能です。
db の部分を変更すれば、タンパクの配列や、PubMed の情報も取得できます。どのようなオプションが使用できるかは、下記に詳しく書かれています。
> http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK25501/
このような API を手動ではなく、コンピューターにプログラムして用いる場合は、アクセスの頻度にご注意ください。NCBIでは、サーバーに負荷がかからないように、「1秒間に3回以上の問い合わせを避けるように」とされています。また、週末に大規模な問い合わせ（ジョブ）をすることも避けるべきです。（万が一トラブルが発生したときに対応できる人がいないためと思われます。）
“In order not to overload the E-utility servers, NCBI recommends that users post no more than three URL requests per second and limit large jobs to either weekends or between 9:00 PM and 5:00 AM Eastern time during weekdays. ”
> http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK25497/
もし、過度な違反があった場合は、組織レベル（ラボ単位、大学単位）でのアクセス制限が課せられる場合もありますので、ご注意ください。