「特定の遺伝子が、どの組織で発現しているか?」を調べるには、 BioGPS を使います。遺伝子名またはタンパク名、プローブID (Affymetrix) で検索すると、対象の遺伝子の複数の組織や細胞における発現レベルが棒グラフで表示されます。また、発現レベルを表示するだけでなく、他のデータベースや、siRNAなどの試薬へのリンクもあります(レイアウトと呼ばれています)。
BioGPS は、おもに Affymetrix 社のマイクロアレイ (GeneChip) を用いて、データを取得しています。データは、GEO に公開されており、ダウンロードして利用することもできます。
モバイルサイト(携帯、スマートフォン向けのページ)もあります。また、iPhoneアプリも公開されています。シンプルな画面で、ちょっと確認したいときは便利かもしれません。
* Wu C, MacLeod I, Su AI (2013) BioGPS and MyGene.info: organizing online, gene-entric information. Nucl. Acids Res.41(D1): D561-D565. (*Database Issue*)
* Wu C, Orozco C, Boyer J, Leglise M, Goodale J, Batalov S, Hodge CL, Haase J, Janes J, Huss JW 3rd, Su AI (2009) BioGPS: an extensible and customizable portal for querying and organizing gene annotation resources. Genome Biol.10(11):R130.
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