インプリンティングを受けることが知られている遺伝子 (imprinted genes) のデータベースがあります。その名の通り、 “geneimprint” です。
上部の “genes” をクリックすると、インプリンティングを受ける遺伝子のリストが確認できます。生物種ごとにまとめられています。
日本エピジェネティクス研究会のページにも、その他のデータベースへのリンク集があります。
* Dr. Randy L. Jirtle; http://randyjirtle.com
インプリンティングを受けることが知られている遺伝子 (imprinted genes) のデータベースがあります。その名の通り、 “geneimprint” です。
上部の “genes” をクリックすると、インプリンティングを受ける遺伝子のリストが確認できます。生物種ごとにまとめられています。
日本エピジェネティクス研究会のページにも、その他のデータベースへのリンク集があります。
* Dr. Randy L. Jirtle; http://randyjirtle.com
通常、MAプロットは、log2変換された値を用いて示されます。
見慣れないというかたは、次の対数目盛り(2のべき乗)の結果と見比べてみてください。
M = 0 のところが、2の0乗、すなわち、ratio = 1です。また、A = 10 は、2の10乗、すなわち、 1024です。赤い部分は、 ratio > 2 の遺伝子です。青い部分は、 ratio < 0.5 の遺伝子です。
プロット図の左に行くほど、シグナル値は低く、右に行くほど、シグナル値は高いです。赤い部分または青い部分を見ると、大きく変動している遺伝子が多いように見えますが、それらのほとんどが、シグナル値の低い部分に集中していることが実感できるのではないでしょうか?(シグナル値の平均値が 32 以下。)